防污公约》在附件 I《防止油类污染》、附件 II《控制有毒液体物质污染》、附件 IV《防止船舶污水污染》和附件 V《防止船舶垃圾污染》中将某些海域定义为 "特殊海域"，在这些海域中，由于与其海洋学和生态条件以及海上交通有关的技术原因，需要采取特殊的强制性方法来防止海洋污染。根据《公约》，这些特殊区域的保护水平高于其他海域。
附件 VI《防止船舶空气污染条例》规定了某些硫氧化物（SOx）排放控制区，对硫排放实行更严格的控制，并规定了氮氧化物（NOx）排放控制区，对氮氧化物排放标准实行三级控制。
防污公约》规定的特殊区域如下：
特殊区域的通过、生效和生效日期
特殊区域
通过 #
生效日期
生效日期
附件 I：石油地中海1973 年 11 月 2 日1983 年 10 月 2 日1983 年 10 月 2 日波罗的海1973 年 11 月 2 日1983 年 10 月 2 日1983 年 10 月 2 日黑海1973 年 11 月 2 日1983 年 10 月 2 日1983 年 10 月 2 日红海1973 年 11 月 2 日1983 年 10 月 2 日
*"海湾地区1973年11月2日1983 年 10 月 2 日2008 年 8 月 1 日亚丁湾1987 年 12 月 1 日1989 年 4 月 1 日
*南极地区1990 年 11 月 16 日1992 年 3 月 17 日1992 年 3 月 17 日西北欧水域1997 年 9 月 25 日1999 年 2 月 1 日1999 年 8 月 1 日阿拉伯海阿曼地区2004 年 10 月 15 日2007 年 1 月 1 日
*南非南部水域2006 年 10 月 13 日2008 年 3 月 1 日2008 年 8 月 1 日
附件二：有毒液体物质南极地区1992 年 10 月 30 日1994 年 7 月 1 日1994 年 7 月 1 日
附件 IV：污水波罗的海2011 年 7 月 15 日2013 年 1 月 1 日**
附件五：垃圾地中海1973 年 11 月 2 日1988 年 12 月 31 日2009 年 5 月 1 日波罗的海1973 年 11 月 2 日1988 年 12 月 31 日1989 年 10 月 1 日黑海1973年11月2日1988 年 12 月 31 日
*红海1973年11月2日1988 年 12 月 31 日
*"海湾地区1973年11月2日1988 年 12 月 31 日2008 年 8 月 1 日北海1989 年 10 月 17 日1991 年 2 月 18 日1991 年 2 月 18 日南极地区（南纬 60 度以南）1990 年 11 月 16 日1992 年 3 月 17 日1992 年 3 月 17 日大加勒比地区，包括墨西哥湾和加勒比海1991 年 7 月 4 日1993 年 4 月 4 日2011 年 5 月 1 日
附件 VI：防止船舶造成空气污染（排放控制区）波罗的海 (SOx) (氮氧化物）1997 年 9 月 26 日2017 年 7 月 7 日2005 年 5 月 19 日2019 年 1 月 1 日2006 年 5 月 19 日2021 年 1 月 1 日****北海 (SOx)(氮氧化物）2005 年 7 月 22 日2017 年 7 月 7 日2006 年 11 月 22 日2019 年 1 月 1 日2007 年 11 月 22 日2021 年 1 月 1 日****北美 ECA (二氧化硫和可吸入颗粒物）(氮氧化物）2010 年 3 月 26 日2011 年 8 月 1 日2012 年 8 月 1 日2016 年 1 月 1 日***美国 加勒比海 ECA (硫氧化物和可吸入颗粒物）(氮氧化物）2011 年 7 月 26 日2013 年 1 月 1 日2014 年 1 月 1 日2016 年 1 月 1 日***# 截至 2002 年 12 月 31 日国际海事组织或其秘书长履行保存或其他职能的多边公约和文书的状况。
* 这些地区的特殊区域要求尚未生效，因为海岸线与相关特殊区域接壤的《防止船污公约》缔约方未就是否存在适当的接收设施发出通知（《防止船污公约》附则 I 第 38.6 条和《防止船污公约》附则 V 第 5(4)条）。
** 新的特殊区域要求于 2013 年 1 月 1 日生效，只有在收到海岸线与相关特殊区域接壤的《防污 公约》附件四缔约方关于存在适当接收设施的充分通知后才能生效（MEPC.200(62)号决 议通过并于 2013 年 1 月 1 日生效的《防污公约》附件四修订本第 13.2 条）。
*** 2016 年 1 月 1 日或之后建造并在这些排放控制区运营的船舶应遵守《防污公约》附则 VI 第 13.5 条规定的氮氧化物 Tier III 标准。
**** 2021 年 1 月 1 日或之后建造并在这些排放控制区运营的船舶应符合《防污公约》附则 VI 第 13.5 条规定的氮氧化物三级标准。
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